Для увеличения сбросов до 4000 м³/сек затворы плотины подняли еще на два метра. Такой уровень сбросов безопасен для Новосибирска и не вызывает подтоплений строений в нижнем бьефе, возведенных в соответствии с существующими нормативами. Уровень Новосибирского водохранилища составляет 112,24 м, что ниже нормального подпорного уровня на 126 см, уровень нижнего бьефа находится на отметке 96,11 м.
Подготовка Новосибирского водохранилища к приходу паводковых вод с верховьев Оби началась 30 мая. В течение трех дней расходы воды через ГЭС были постепенно увеличены с исходных 2000 м³/сек в два раза. Увеличение пропуска воды производилось через загрузку гидроагрегатов, а после исчерпания их пропускной способности были начаты холостые сбросы через водосливную плотину.
Сейчас в работе находятся шесть гидроагрегатов с суммарной нагрузкой 380 МВт и максимальной пропускной способностью 3100 м³/сек, еще один гидроагрегат находится в реконструкции с заменой турбины. На 2 июня приток воды к створу Новосибирской ГЭС составляет 2640 м³/сек и по прогнозу к концу первой декады июня постепенно увеличится до 5200 - 5800 м³/сек.
В Верхне-Обском БВУ состоялось заседание межведомственной рабочей группы (МРГ) по регулированию режима работы Новосибирского водохранилища в связи с дождевым паводком на Алтае. На нем обсудили необходимые меры для приёма волны паводка, которая ожидается в ближайшее время. Как отметил и.о. руководителя Верхне-Обского бассейнового водного управления Василия Борисенко, уже сегодня наблюдается спад воды в притоках Бии и Катуни. Для дождевого паводка характерен скоротечный всплеск с быстрым подъемом воды, и интенсивным спадом. В Барнауле пик притока дождевого паводка ожидается 4-5 июня. Эта волна дойдёт до Новосибирского водохранилища за пять дней, изменение режимов работы Новосибирской ГЭС будет осуществляться по ходу развития паводка в режиме реального времени.
Сооружения и оборудование Новосибирской ГЭС полностью готовы к пропуску паводка. Специалисты гидроэлектростанции заблаговременно завершили ремонты гидроагрегатов, провели ревизию кранового оборудования для маневрирования затворами водосливной плотины, проверили состояние затворов и сороудерживающих решёток. Оперативный персонал и ремонтные бригады готовы к ликвидации возможных чрезвычайных ситуаций и маневрированию затворами водосливной плотины в любое время суток. В постоянном режиме проводится мониторинг уровня воды в водохранилище и объема приточности.